ISO 37301:2021合规管理体系标准认证流程与常规管理体系的认证流程大体相同。主要步骤包括：
认证申请
与认证机构人员联系，填写有关认证申请表；商讨认证审核时间安排事项；合规管理体系有效运行三个月后可进行认证审核。
第一阶段审核
第一阶段审核的重点是合规管理体系文件评审，并收集必要的信息资料，评价合规管理体系的运行水平，验证为第二阶段审核的准备情况，策划二阶段审核的重点，评审二阶段审核的资源分配，等等。
第二阶段审核
第二阶段审核是完整条款、完整体系的审核。ISO 37301:2021合规管理体系标准的所有款要求均须覆盖，以评价合规管理体系实施的符合性和有效性。
技术评审
认证机构按规定的程序对所有的审核资料和评估报告进行评审、批准，做出认证决定，签发认证证书。ISO 37301:2021认证证书使用DNV标准证书模板，证书有效期为3年。
证书保持
认证机构实施合规管理体系年度监督审核，确认管理体系保持和持续改进情况。在现有认证证书到期前进行换证审核。